\documentclass[11pt]{xepersian-thesis}%leqno, twoside,
%\usepackage{natbib}
\usepackage{graphicx}
\usepackage{verbatim}
\usepackage{pdfsync}
\usepackage{makeidx}
\usepackage{pdfpages} %For including multiple pages pdf
%\usepackage{backref} 
\usepackage[rm,RM]{subfigure}
\usepackage{algorithm}
\usepackage{algorithmic}
\usepackage{setspace}
%\usepackage{bibentry}
\usepackage{amsmath}
\usepackage[linktocpage=true,pagebackref=true]{hyperref}%,colorlinks,pagebackref=true
%\usepackage{hyperref}
\usepackage{tocbibind}% برای آنکه مراجع هم در فهرست بیاید
\usepackage{fancyhdr}% مربوط به سربرگ
\usepackage{verbatim}

\usepackage{xepersian}

\settextfont[Scale=1]{XB Zar}%{XB Niloofar}%{XB Zar}%{B Nazanin}%
%\setlatintextfont[Scale=.9]{Linux Libertine}%{Times New Roman}
\setdigitfont{XB Niloofar}
\defpersianfont\NazaninBold[Scale=1]{XB Zar}%{B Nazanin Bold}
\defpersianfont\iranic[Scale=.8]{XB Zar Oblique}

%\defaultfontfeatures{Scale=MatchLowercase} %بنا به گفته‌ی وفا به جای تنظیم مقیاس فونت می‌توان از این دستور استفاده کرد

%\frenchspacing
%\onehalfspacing
%\doublespacing 
%\baselineskip{1.5\baselineskip}
%\def\FarsiSpace {\baselineskip=40pt}
%\AtBeginDocument{\FarsiSpace}

% ایجاد سربرگ		
% \pagestyle{fancy}
% %\cfoot{}
% %\lhead{\thepage}

% \renewcommand{\chaptermark}[1]{\markboth{\small\chaptername{} \thechapter: #1}{}}
% \renewcommand{\sectionmark}[1]{\markright{\small\thesection : #1}}

% \fancyhf{}
% \fancyhf[OLH]{\rightmark}
% \fancyhf[ERH]{\leftmark}
% \fancyhf[ORH,ELH]{\thepage}

\makeindex

\input{myNewCommands.tex}

%\makeatletter
%%\let\@chapter\ol@chapter
%\renewcommand\appendix{\par
% % \setcounter{chapter}{0}%
% % \setcounter{section}{0}%
%  \gdef\@chapapp{\appendixname}%
%  \gdef\thechapter{\@harfi\c@chapter}
%}
%
%%\AtBeginDocument{\ifx\persianfont@sf\undefined\let\persianfont@sf\persianfont\fi}
%%\AtBeginDocument{\ifx\persianfont@tt\undefined\let\persianfont@tt\persianfont\fi}
%\makeatother

% \setpersiansansfont{XB Zar}
% \setpersianmonofont{XB Zar}

% \expandafter\renewcommand\csname lr\endcsname[2][]{\LR{\resetlatinfont#2}}
% \newcommand{\latinindex}[1]{\index{\lr{#1}}}

\begin{document}% و فرمان \end انتهایی را داشته باشد.
%\nobibliography*

\include{CoverPage_and_Abstract_fa}                   % صفحه اول و چکیده فارسی
%\pagenumbering{harfi}
\tableofcontents        % فهرست مندرجات را تولید می‌کند.
%\listoffigures          % لیست اشکال را تولید می‌کند.
\listoftables
%\setcounter{@page@}{۱۰}  % شماره‌ی صفحه از ۱ شروع می‌شود.

%\end{comment}
%\pagenumbering{arabic}
%\include{intro}                   % فصل ۱: مقدمه
%\include{ImageRegistration}       % فصل ۲: مروری بر برخی از تکنیک های Registration Image
%\include{SR_literatures}          %فصل ۳:مروری بر تکنیک های Super Resolution
%\include{SR_Open_Problems}        %فصل ۴: {مسائل بازِ «فوق دقت» از نگاه دیگران }
%\include{Our_Direction}           %فصل ۵: {جهت گیری ما }
\include{Fusion}
%\include{ICEE2009_farsi}
%\include{test_stack_error}
%\include{Experimental_Results}	   %نتایج پیاده‌سازی
%\renewcommand{\thesection}{\arabic{section}} 
\appendix                           %فصلهای پس از این قسمت به عنوان ضمیمه خواهند آمد.
%\include{FTerms}                   % اصطلاحات
%\include{ObjectRecognition}          %فصل :مروری بر برخی از تکنیکهای شناسائی اشیاء 
%\include{dicE2F}        % واژه‌نامه فارسی به انگلیسی
%\include{dicF2E}        % واژه‌نامه انگلیسی به فارسی
%\include{misc}			 % موارد متفرقه و از جمله نوشتن پایان نامه

%\begin{latin}
%\makeatletter\def\@@number#1{#1}\makeatother
\bibliographystyle{ieeetr-fa}%{plainnat}%{newapa}%{IEEEtran}%{acm}%{abbrv}%%{amsalpha}%{apacite}{abbrvnat}%
\bibliography{SR_References}
%\end{latin}
\include{CoverPage_and_Abstract_en}                   % عنوان و چکیده انگلیسی

\printindex

\end{document}

