\documentclass[10pt, twoside,a4paper,openany]{xepersian-thesis-MAT}%,leqno,
\usepackage{natbib}%[square]numbers,
\usepackage{graphicx}
\usepackage{verbatim}
\usepackage{pdfsync}
\usepackage{makeidx}
\usepackage{pdfpages} %For including multiple pages pdf
%\usepackage{backref} 
\usepackage{algorithm}
\usepackage{algorithmic}
\usepackage{setspace}
%\usepackage{bibentry}
\usepackage{amsmath}
\usepackage{amssymb}
%\usepackage{pifont}
\usepackage[linktocpage=true,colorlinks,pagebackref=true,citecolor=blue]{hyperref}%,pagebackref=true
%\usepackage{hyperref},breaklinks=true
%\hypersetup{pdfpagemode=FullScreen} 
\usepackage[top=30mm, bottom=30mm, left=25mm, right=40mm]{geometry}

\usepackage{tocbibind}% برای آنکه مراجع هم در فهرست بیاید
\usepackage{fancyhdr}% مربوط به سربرگ
\usepackage{verbatim}
\usepackage{lineno}
\usepackage{supertabular}
\usepackage{booktabs}
\usepackage{hhline}
\usepackage{tabularx}
\usepackage{mat-rotating}
\usepackage{pgfplots}
\usetikzlibrary{plotmarks}
\usepackage{subfigure}

\usepackage{persianpoem}

\usepackage{xepersian}
% برای مشکل defpersianfont
\ExplSyntaxOn
\cs_set_eq:cN {zf@fontspec} \fontspec_select:nn
\ExplSyntaxOff


\settextfont[Scale=1.2]{XB Niloofar}%{Yas}%{B Nazanin}%{XB Zar}%{XB Zar}%
\setlatintextfont[Scale=1]{Times New Roman}%{Linux Libertine}%


\setdigitfont[Scale=1.2]{Yas}%{Parsi Digits}%این پارسی دیجیتس با مت‌بی‌اف مشکل دارد و کلی مرا اذیت کرد
\defpersianfont\NazaninBold[Scale=1]{XB Niloofar}%Zar}%{B Nazanin Bold}
\defpersianfont\iranic[Scale=1.1]{XB Zar Oblique}%Italic}%
\defpersianfont\nastaliq[Scale=1]{IranNastaliq}
\setpookfont{XB Kayhan Pook}
%\setiranicfont{XB Zar Oblique}
%\setpersianmonofont{Adobe Arabic}%{DejaVu Sans Mono}
%\setpersiansansfont{XB Niloofar}%{DejaVu Sans}
\SepMark{-}

%\usepackage[rm,RM]{subfigure}
\usepackage{mybib}%برای حاشیه دار بودن مراجع
%\usepackage{syntonly}
% تغییر فونت برچسب شکل‌ها
%\usepackage[margin=0mm,font={small},labelfont={small}]{caption}
%\defaultfontfeatures{Scale=MatchLowercase} %بنا به گفته‌ی وفا به جای تنظیم مقیاس فونت می‌توان از این دستور استفاده کرد



%\frenchspacing
%\onehalfspacing
%\doublespacing 
%\baselineskip{2\baselineskip}
\def\mytextbaseline{1.5}
\def\mytablebaseline{1}
\renewcommand{\baselinestretch}{\mytextbaseline}
%\def\FarsiSpace {\baselineskip=40pt}
%\AtBeginDocument{\FarsiSpace}

%\newcommand{\mycompacttable[1]}{\renewcommand{\baselinestretch}{1} 
%{#1}
%\renewcommand{\baselinestretch}{1}}

%%ایجاد سربرگ		
\pagestyle{fancy}
%%\cfoot{}
%%\lhead{\thepage}
%
%%\renewcommand{\chaptermark}[1]{\markboth{\small\chaptername{} \thechapter: #1}{}}
%%\renewcommand{\sectionmark}[1]{\markright{\small\thesection : #1}}
%
\fancyhf{}
\fancyhf[OLH]{\rightmark}
\fancyhf[ERH]{\leftmark}
\fancyhf[ORH,ELH]{\thepage}

\makeindex

\input{myNewCommands.tex}
\def\bibname{مراجع}
\numberwithin{algorithm}{chapter}


\begin{document}% و فرمان \end انتهایی را داشته باشد.
%\nobibliography*

\include{CoverPage_and_Abstract_fa}                   % صفحه اول و چکیده فارسی
%\setcounter{page}{1}
\tableofcontents        % فهرست مندرجات را تولید می‌کند.
\listoffigures          % لیست اشکال را تولید می‌کند.
\listoftables
\listofalgorithms
%%\linenumbers
%سلام
\newpage
\pagenumbering{arabic}\setcounter{page}{1}
\include{intro}                   % فصل ۱: مقدمه
%\addcontentsline{toc}{part}{قسمت}
\part{ مروری بر ادبیات موضوع}
\include{ImageRegistration}       % فصل ۲: مروری بر برخی از تکنیک های Registration Image
\include{SR_literatures}          %فصل ۳:مروری بر تکنیک های Super Resolution
%%\include{Our_Direction}           %فصل ۵: {جهت گیری ما }

\include{CSICC2009}
\include{Fusion}
\include{ICEE2009_farsi}

\include{Video}

\include{QR}
\include{OXYTSIFT}
\include{IBP_SSIM}
\include{SR_Open_Problems}        %فصل ۴: {مسائل بازِ }

\part{پیوست‌ها}
\appendix                           %فصلهای پس از این قسمت به عنوان ضمیمه خواهند آمد.


%\include{Tables}
%%\makeatletter
%%\def\thechapter{\@arabic\c@chapter}
%%\makeatother
\include{FTerms}                   % اصطلاحات
%%\include{ObjectRecognition}          %فصل :مروری بر برخی از تکنیکهای شناسائی اشیاء 
\include{Experimental_Results}	   %نتایج پیاده‌سازی
\include{videoQuality}
\include{DerivationOfESDIS}
\include{IBPSDIS}
\include{dicE2F}         % واژه‌نامه انگلیسی به فارسی
%%%\include{dicF2E}       % واژه‌نامه فارسی به انگلیسی
%%\include{misc}			 % موارد متفرقه و از جمله نوشتن پایان نامه

%\makeatletter\def\@@number#1{#1}\makeatother
\addcontentsline{toc}{chapter}{\bibname}
\bibliographystyle{asa-fa}%{chicago-fa}%{ieeetr-iust}
%{plainnat}%{newapa}%{IEEEtran}%{acm}%{abbrv}%%{amsalpha}%{apacite}{abbrvnat}%
\bibliography{SR_References}
\include{CoverPage_and_Abstract_en}                   % عنوان و چکیده انگلیسی

\printindex

\end{document}

